Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
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Gde1Q9JL56 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Gde1Q9JL56 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Gde1Q9JL56 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Gde1Q9JL56 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Gde1Q9JL56 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Gde1Q9JL56 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Gde1Q9JL56 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Gde1Q9JL56 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Gde1Q9JL56 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Gde1Q9JL56 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Gde1Q9JL56 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Gde1Q9JL56 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms