Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Hmgn5Q9JL35 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Hmgn5Q9JL35 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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