Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Habp4Q9JKS5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms