Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rnf6Q9DBU5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rnf6Q9DBU5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rnf6Q9DBU5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rnf6Q9DBU5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rnf6Q9DBU5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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