Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Xrn2Q9DBR1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Xrn2Q9DBR1 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Xrn2Q9DBR1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrn2Q9DBR1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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