Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pop5Q9DB28 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pop5Q9DB28 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pop5Q9DB28 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pop5Q9DB28 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pop5Q9DB28 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms