Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccdc89Q9DA73 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc89Q9DA73 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc89Q9DA73 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc89Q9DA73 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc89Q9DA73 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc89Q9DA73 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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