Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Snx5Q9D8U8 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Snx5Q9D8U8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Snx5Q9D8U8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Snx5Q9D8U8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Snx5Q9D8U8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Snx5Q9D8U8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx5Q9D8U8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx5Q9D8U8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx5Q9D8U8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx5Q9D8U8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx5Q9D8U8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx5Q9D8U8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx5Q9D8U8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx5Q9D8U8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx5Q9D8U8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx5Q9D8U8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx5Q9D8U8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx5Q9D8U8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx5Q9D8U8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx5Q9D8U8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx5Q9D8U8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx5Q9D8U8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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Snx5Q9D8U8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx5Q9D8U8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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