Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms