Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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