Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Capns2Q9D7J7 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Capns2Q9D7J7 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms