Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms