Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms