Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PrameQ9D4Z5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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