Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gcc1Q9D4H2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms