Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms