Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms