Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf2lQ9D478 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Odf2lQ9D478 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Odf2lQ9D478 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Odf2lQ9D478 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Odf2lQ9D478 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms