Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
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Cfap53Q9D439 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cfap53Q9D439 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cfap53Q9D439 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cfap53Q9D439 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cfap53Q9D439 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cfap53Q9D439 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cfap53Q9D439 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Cfap53Q9D439 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Cfap53Q9D439 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cfap53Q9D439 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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