Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms