Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms