Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Mms19Q9D071 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Mms19Q9D071 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Mms19Q9D071 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Mms19Q9D071 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Mms19Q9D071 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Mms19Q9D071 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Mms19Q9D071 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Mms19Q9D071 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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