Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms