Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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