Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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