Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BccipQ9CWI3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms