Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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