Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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