Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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