Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms