Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med4Q9CQA5 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms