Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms