Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Chmp3Q9CQ10 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Chmp3Q9CQ10 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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