Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms