Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ssxb1Q9CPU1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ssxb1Q9CPU1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb1Q9CPU1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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