Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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