Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cntnap4Q99P47 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cntnap4Q99P47 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cntnap4Q99P47 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cntnap4Q99P47 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cntnap4Q99P47 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cntnap4Q99P47 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cntnap4Q99P47 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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