Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms