Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms