Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms