Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms