Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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Ctu1Q99J10 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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Ctu1Q99J10 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ctu1Q99J10 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ctu1Q99J10 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctu1Q99J10 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Ctu1Q99J10 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ctu1Q99J10 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ctu1Q99J10 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
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Ctu1Q99J10 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ctu1Q99J10 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ctu1Q99J10 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctu1Q99J10 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ctu1Q99J10 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctu1Q99J10 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctu1Q99J10 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctu1Q99J10 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Ctu1Q99J10 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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