Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn16Q925N4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms