Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spdl1Q923A2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spdl1Q923A2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms