Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms