Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Afg3l1Q920A7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms