Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atl3Q91YH5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atl3Q91YH5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atl3Q91YH5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atl3Q91YH5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atl3Q91YH5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atl3Q91YH5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atl3Q91YH5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atl3Q91YH5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms