Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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