Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ttc8Q8VD72 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ttc8Q8VD72 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ttc8Q8VD72 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ttc8Q8VD72 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ttc8Q8VD72 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms