Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Sft2d2Q8VD57 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Sft2d2Q8VD57 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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Sft2d2Q8VD57 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms